A Honda Racing brit tesztversenyzője, Anthony Davidson a Maláj Nagydíj pénteki második szabadedzésén letaszította a képzeletbeli trónról a Williams istálló osztrák tesztelőjét, Alexander Wurz-ot, aki a reggeli tréningen remekelt. Anthony egy kicsúszással kezdett, azonban az edzés végén futott gyorskörével, az első tréninget megnyerő Alex Wurz előtt végzett. A Honda brit tesztpilótája, 1:35.041-es időt ért el, miközben a hőmérők higanyszála egyre feljebb kúszott Sepangban. A világbajnoki cím birtokosa, Fernando Alonso, aki az elmúlt héten megrendezett szezonnyitó viadalon nem talált legyőzőre, 14 kör megtétele után futott 1:35.806-os idejével a harmadik pozícióban landolt, mellyel a versenyzők közül a leggyorsabbnak bizonyult. A negyedik helyen az új erőforrással futó Felipe Massa végzett, akit a McLaren finn versenyzője, Kimi Raikkönen követett. Alonso csapattársa, Giancarlo Fisichella hetedikként futott be a hétszeres világbajnok, Michael Schumacher előtt, akit a nyolcadik helyen a Honda Racing brit versenyzője, Jenson Button követett. Juan Pablo Montoya, akit az első tréningen a leggyorsabb versenyzőként tartottak számon, joggal lehet csalódott a délutáni edzést követően, ugyanis félidőben megállt alatta a McLaren a boxutcában. Bár később ismét pályára tudott gördülni, megpördült, így a 14. helynél előrébb nem tudott kerülni. A reggeli tréningen egyébként a legtöbb versenyző a boxban várakozott, hogy ezzel is spóroljanak erőforrásaikkal, melyek a hétvégén immáron zsinórban második versenyüket fogják teljesíteni. Maláj Nagydíj – második szabadedzés: 01. - Davidson - Honda (M) 1:35.041 - 14 kör 02. - Wurz - Williams-Cosworth (B) 1:35.388 + 0.347 - 30 kör 03. - Alonso - Renault (M) 1:35.806 + 0.765 - 14 kör 04. - Massa - Ferrari (B) 1:35.924 + 0.883 - 22 kör 05. - Raikkonen - McLaren-Mercedes (M) 1:36.132 + 1.091 - 15 kör 06. - Fisichella - Renault (M) 1:36.182 + 1.141 - 14 kör 07. - M.Schumacher - Ferrari (B) 1:36.617 + 1.576 - 17 kör 08. - Button - Honda (M) 1:36.661 + 1.620 - 12 kör 09. - Villeneuve - BMW-Sauber (M) 1:37.045 + 2.004 - 9 kör 10. - Barrichello - Honda (M) 1:37.270 + 2.229 - 13 kör 11. - R.Schumacher - Toyota (B) 1:37.317 + 2.276 - 23 kör 12. - Heidfeld - BMW-Sauber (M) 1:37.418 + 2.377 - 7 kör 13. - Kubica - BMW-Sauber (M) 1:37.457 + 2.416 - 28 kör 14. - Montoya - McLaren-Mercedes (M) 1:37.463 + 2.422 - 12 kör 15. - Liuzzi - Toro Rosso-Cosworth (M) 1:37.590 + 2.549 - 22 kör 16. - Coulthard - Red Bull-Ferrari (M) 1:37.603 + 2.562 - 8 kör 17. - Trulli - Toyota (B) 1:37.695 + 2.654 - 20 kör 18. - Jani - Toro Rosso-Cosworth (M) 1:37.831 + 2.790 - 23 kör 19. - Speed - Toro Rosso-Cosworth (M) 1:37.926 + 2.885 - 21 kör 20. - Webber - Williams-Cosworth (B) 1:38.081 + 3.040 - 5 kör 21. - Rosberg - Williams-Cosworth (B) 1:38.205 + 3.164 - 6 kör 22. - Mondini - MF1-Toyota (B) 1:38.256 + 3.215 - 20 kör 23. - Klien - Red Bull-Ferrari (M) 1:38.644 + 3.603 - 10 kör 24. - Albers - MF1-Toyota (B) 1:38.918 + 3.877 - 20 kör 25. - Doornbos - Red Bull-Ferrari (M) 1:39.105 + 4.064 - 28 kör 26. - Monteiro - MF1-Toyota (B) 1:39.416 + 4.375 - 20 kör 27. - Sato - Super Aguri-Honda (B) 1:41.549 + 6.508 - 22 kör 28. - Ide - Super Aguri-Honda (B) 1:43.164 + 8.123 - 16 kör